Sau một thời gian hoạt động tại Châu Phi, ông đầu quân cho hãng thời sự ảnh danh tiếng Magnum Photos Agency và chuyển sang vùng Đông Nam Á, nơi ông theo dõi cuộc chiến Việt Nam từ năm 1966 tới 1971.

Griffiths ghi lại những cảnh binh lính Mỹ vật lộn vất vả trong các vùng tranh chấp ác liệt với đối phương. Đồng nghiệp của ông tại Magnum là Henri Cartier-Bresson nhận xét về các tác phẩm của ông: "kể từ thời kỳ Goya tới nay, chưa từng có ai khắc họa cuộc chiến sâu sắc được như Philip Jones Griffiths.

"Nhiều bức hình của Griffiths xoáy vào những hậu quả mà cuộc chiến gây ra cho dân thường. Nói chuyện với BBC hồi năm 2005, ông nói "Tôi muốn cho mọi người thấy rằng người dân Việt Nam là đối tượng mà người Mỹ cần đua tranh chứ không phải hủy diệt."  

Ông kể: "Người phụ nữ Việt Nam này được cho đeo biển hiệu là dân thường, có lẽ do một y tá quân y nhân hậu nào đó. Điều này khá bất thường, bởi dân thường khi bị thương thường bị đeo biển đánh dấu là đối tượng tình nghi là Việt Cộng, còn người chết thường bị gán là Việt Cộng."

Sau cuộc chiến Việt Nam, Griffiths di chuyển làm việc tại trên 120 quốc gia, trong đó có cả Grenada, khi nơi này bị Hoa Kỳ xâm chiếm hồi 1983.

Philip Jones Griffiths thường trở lại thăm Việt Nam. Năm 2005, ông công bố "Việt Nam thời bình", một công trình nghiên cứu dài 25 năm, tìm hiểu về những hậu quả dài hạn của cuộc chiến tại nơi này.

Trong một tuyên bố, đương kim chủ tịch Magnum Photos nói: "Philip đã làm giàu cho cuộc sống chúng ta bằng lòng quả cảm, sự đồng cảm, niềm đam mê, sự dí dỏm và thông minh của ông. Với nhiều người, ông đã đem đến cho nghiệp báo chí một tâm hồn đạo đức." Đây là hình ảnh về Philip Jones Griffiths do John Giannini chụp.